최근의 메타게놈 연구에 따르면 헤이룽장성 설치류가 보유하는 바이러스와 박테리아의 스펙트럼이 놀라울 정도로 다양하며, 여기에는 라싸 바이러스, 아무르 바이러스, 살모넬라균, 페스트균 등이 포함됩니다.
본 연구는 다음을 활용하였다.Macro & Micro-Test의 병원균 RNA 농축 키트프로브 포획 기술을 기반으로 한 이 방법은 숙주 rRNA 및 기타 보존된 숙주 단편을 선택적으로 제거함으로써 미생물 RNA를 효과적으로 유지하여 병원체 검출 감도를 크게 향상시켰습니다. 이러한 병원체 RNA 농축 단계는 높은 검출률을 달성하는 데 매우 중요했으며 병원체 감시를 위한 강력한 기술적 지원을 제공했습니다.
설치류: 인수공통전염병의 주요 숙주
설치류는 포유류 중에서 종이 가장 다양하고 분포가 가장 넓은 집단으로, 전 세계적으로 2,000종 이상이 있으며 모든 포유류 종의 40% 이상을 차지합니다.
설치류는 생태학적 중요성 외에도 수많은 인수공통 전염병 병원체의 주요 숙주이자 매개체 역할을 합니다.설치류의 서식지는 인간의 환경과 자주 겹치기 때문에(직접적인 물림, 배설물과의 접촉, 또는 벼룩과 진드기를 통한 간접적인 전파 등) 설치류가 보유하는 병원균은 지속적인 공중 보건 위협을 초래합니다.
특히, 신종 감염병의 70% 이상이 야생 동물에서 유래하며, 설치류는 가장 중요한 바이러스 저장소 중 하나입니다.
헤이룽장성 접경 지역: 병원체 감시의 최전선
중국 동북부의 국경 지대인 헤이룽장성은 풍부한 생태 자원을 보유하고 있으며 여러 국가와 국경을 접하고 있습니다. 이러한 풍부한 생물 다양성과 빈번한 국경 인구 이동은 병원체 전파에 유리한 환경을 조성합니다.
2021년 6월과 7월 사이에 연구진은 무단장시 헝다오허즈진에서 야생 설치류 67마리를 채집했습니다. 채집된 표본은 다음과 같습니다.
l 20아포데무스 반도
l 47미오데스 루포카누스
모든 표본은 주거 지역과 주변 농경지에서 포획되었으며, 이는 인간 거주지와 야생 동물 서식지 사이의 밀접한 접촉을 보여줍니다.
병원체 농축 기술: 숙주 배경 간섭 극복
메타게놈 시퀀싱에서 숙주 RNA는 일반적으로 시퀀싱 판독값의 대부분을 차지하여 저농도의 병원체 신호를 가립니다.
이러한 문제를 해결하기 위해 본 연구에서는 다음과 같은 방법을 사용했습니다.Macro & Micro-Test의 병원균 메타게놈 검출 키트. 프로브 포획 기술을 사용하면 특수하게 설계된 프로브가 숙주 rRNA 및 보존 서열에 결합하여 이를 제거하고 미생물 RNA를 풍부하게 만들 수 있습니다.
이 접근 방식은 병원체 검출 감도를 크게 향상시켜 후속 시퀀싱에서 더 높은 비율의 병원체 염기서열을 확보할 수 있도록 했습니다. 이러한 농축 단계는 설치류가 보유하는 병원체 스펙트럼을 정확하게 특성화하는 데 견고한 토대를 마련했습니다.
농축 과정을 거친 후, RNA 샘플은 역전사, 라이브러리 구축 및 고처리량 시퀀싱을 거쳤습니다. 생물정보학 분석에는 다음이 포함되었습니다.
l 호스트 게놈 필터링
Kraken2를 이용한 분류학적 분류
Bracken을 사용한 풍부도 보정
이 워크플로는 바이러스 및 박테리아 군집에 대한 포괄적인 프로필을 생성했습니다.
연구 결과: 여러 바이러스와 박테리아의 동시 순환
바이러스 관련 연구 결과
검출된 바이러스는 21개 바이러스 계통에 속하며, 여기에는 다음이 포함됩니다.아레나바이러스과그리고한타바이러스과.
을 통해데 노보Megahit을 사용하여 어셈블리한 결과 154개의 바이러스 컨티그가 생성되었으며, 그중 110개는 8개 계통의 19개 바이러스와 정렬되었습니다.
In 아포데무스 반도다음과 같은 바이러스가 확인되었습니다.
l 아레나바이러스: 라사 바이러스, 원저우 바이러스, 가이로 바이러스
l 한타바이러스: 아무르바이러스, 푸말라바이러스
In 미오데스 루포카누스쥐동맥바이러스와 아무르바이러스가 검출되었습니다.
이러한 병원균 중에는 다음과 같은 것들이 있습니다:
라싸 바이러스는 바이러스성 출혈열의 원인균으로, 치사율은 약 20%에 달합니다.
아무르 바이러스는 신증후군 출혈열(HFRS)을 유발하는 병원체 중 하나입니다. 중국은 전 세계에서 한타바이러스 감염 부담이 가장 높은 국가입니다.
세균 검사 결과
총 1,051개의 세균 속이 주석 처리되었다.
가장 많이 발견된 속은 다음과 같습니다.
엘살모넬라균(26–31%)
엘예르시니아(11–23%)
살모넬라균장티푸스는 주요 식중독균으로, 전 세계적으로 매년 약 900만 건의 장티푸스 발병과 약 11만 명의 사망자를 발생시키는 원인균입니다.
예르시니아 페스티스흑사병의 원인균인 페스트균은 역사상 세 차례의 대유행을 일으켰습니다. 헤이룽장성은 중국의 자연적인 흑사병 발생지 중 하나로 인식되고 있으며, 흑사병 감시의 우선 지역으로 지정되어 있습니다.
본 연구의 중요성
과학적 기여
본 연구는 헤이룽장성 설치류에서 라싸 바이러스 조각과 쥐동맥염 바이러스가 발견된 첫 번째 사례 보고로서, 중국의 설치류 매개 병원체 데이터베이스를 확장하는 데 기여한다.
이 연구는 지역 설치류 개체군의 바이러스 및 박테리아 군집을 체계적으로 특성화하여 국경 지역의 인수공통전염병 감시를 위한 기초 자료를 제공합니다.
공중 보건에 미치는 영향
이번 연구 결과는 지속적인 감시와 병원체 검사의 필요성을 강조합니다.A. 반도그리고M. rufocanus.
이 자료는 흑사병 및 신증후군 출혈열과 같은 질병에 대한 발생원 통제 전략을 뒷받침하는 과학적 증거를 제공합니다.
방법론적 강점
메타게놈 시퀀싱은 알려진 병원균과 새로운 병원균 모두를 편향 없이 검출할 수 있게 해줍니다.
본 연구에서 매크로앤마이크로테스트의 병원균 농축 기술은 복잡한 생물학적 시료에서 표적 병원균 검출을 효과적으로 향상시키는 뛰어난 성능을 입증했습니다. 이러한 결과는 야생동물 감시 분야에서 고감도 병원균 식별을 지원할 수 있는 본 기술의 역량을 확인시켜 줍니다.
제품 추천
본 연구에서의 성공적인 적용 사례를 바탕으로, 매크로 및 마이크로 테스트 병원체 RNA 농축 키트는 메타게놈 감시 연구에 적극 권장됩니다.
이 키트는 숙주 핵산을 효율적으로 제거하고 미생물 염기서열을 풍부하게 함으로써 검출 감도와 데이터 품질을 크게 향상시킵니다. 복잡한 시료에서 병원체를 정확하게 검출하는 데 필수적인 도구이며, 공중 보건 감시, 인수공통감염병 위험 평가 및 발병 대비에 강력한 기술적 지원을 제공합니다.
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게시 시간: 2026년 3월 2일